Trường đại học Y Dược là sự tiếp nối truyền thống đào tạo Y Dược của đại học Đông Dương - tiền thân của đại học Quốc gia Hà Nội, đồng thời, cũng là những bước hoàn thiện mô hình đại học đa ngành, đa lĩnh vực phù hợp với xu thế chung của các cơ sở giáo dục đại học tiên tiến trên thế giới.
Theo đề án thành lập, trường đại học Y Dược (đại học Quốc gia Hà Nội), phát triển theo định hướng nghiên cứu tiên tiến trong lĩnh vực y tế của khu vực. Trường đào tạo, cung cấp nguồn nhân lực, sản phẩm khoa học chăm sóc sức khỏe ở trình độ cao, chuyển giao công nghệ, từng bước tiếp cận tiêu chuẩn quốc tế.
Về nghiên cứu khoa học, trường đại học Y Dược phát triển dựa trên thế mạnh và phát huy lợi thế nghiên cứu cơ bản, công nghệ cao sẵn có của trung tâm đại học đa ngành, đa lĩnh vực hàng đầu đất nước.
Các hoạt động nghiên cứu khoa học, đổi mới sáng tạo của trường sẽ tập trung theo hướng ứng dụng các thành tựu khoa học và công nghệ mới của đại học Quốc gia Hà Nội vào thực hành lâm sàng, cận lâm sàng và phát triển thuốc, chế phẩm phục vụ điều trị.
Bên cạnh đó, trường hướng tới sản phẩm đầu ra có hàm lượng tri thức, công nghệ cao, trực tiếp giải quyết các vấn đề thực tiễn tồn tại trong lĩnh vực y tế.
Theo kế hoạch, trung bình hàng năm, mỗi cán bộ khoa học công bố ít nhất 2 bài báo, báo cáo khoa học trong nước và quốc tế. Tổng số bài báo quốc tế (được trích dẫn trong hệ thống ISI/Scopus) hàng năm đạt từ 20 công trình trở lên, có ít nhất một quy trình kỹ thuật mới được chuyển giao hoặc cấp bằng sở hữu trí tuệ hay phát minh sáng chế mỗi năm.
Đặc biệt, trường sẽ tập trung phát triển các lĩnh vực có nhu cầu cao của ngành khoa học sức khỏe như Y học, Dược học, công nghệ và kỹ thuật y học hiện đại, kết hợp nghiên cứu và triển khai ứng dụng các sản phẩm khoa học liên ngành…
Theo GS.TS, Thầy thuốc Nhân dân Lê Ngọc Thành, Chủ nhiệm khoa Y Dược (nay là trường đại học Y Dược), trường hoạt động theo cơ chế tự chủ của đơn vị sự nghiệp công lập. Năm 2025, trường xây dựng và hoàn thiện mô hình tiên tiến về đào tạo một số ngành tại đại học Quốc gia Hà Nội với quy mô tuyển sinh đại học mỗi năm khoảng 1.000 sinh viên. Quy mô đào tạo sau đại học/tổng quy mô đào tạo tăng dần và đạt 30%. Tỉ lệ quy mô đào tạo tiến sĩ/quy mô sau đại học đạt 30%. Sinh viên quốc tế chiếm 5%.
Với sự ra đời của trường đại học Y Dược, đại học Quốc gia Hà Nội hiện gồm 8 trường thành viên (trường đại học Khoa học Xã hội và Nhân văn, trường đại học Khoa học Tự nhiên, trường đại học Ngoại ngữ, trường đại học Công nghệ, trường đại học Kinh tế, trường đại học Giáo dục, trường đại học Việt Nhật và trường đại học Y Dược).
Hiện nay, trường đại học Y Dược có số lượng cán bộ cơ hữu là 147 người, trong đó 52 cán bộ giảng dạy, đảm bảo tỉ lệ giảng viên/sinh viên đạt 1/15. Giảng viên có trình độ tiến sĩ chiếm 50%, chức danh giáo sư và phó giáo sư chiếm 27%. Ngoài ra, hơn 350 giảng viên thỉnh giảng là chuyên gia đầu ngành trong các lĩnh vực y học, dược học.
Trường Y Dược phát triển các chương trình đào tạo mới có tính đa ngành như Quản trị bệnh viện (phối hợp khoa Quản trị kinh doanh, khoa Luật, trường đại học Kinh tế), Tin học chăm sóc sức khỏe (phối hợp viện Công nghệ thông tin), Vật lý y khoa (phối hợp trường đại học Khoa học Tự nhiên và trường đại học Công nghệ), Tâm lý học lâm sàng (phối hợp khoa Tâm lý học của trường đại học Khoa học - Xã hội & Nhân văn).